Una vez que el polímero del antígeno O se conecta con el núcleo del lípido A, detendrá la reacción de polimerización. Es decir, la reacción de conexión puede terminar la reacción de polimerización. Tanto el núcleo del lípido A como el lipopolisacárido con unidades repetidas de diferente longitud pueden transferirse de manera efectiva a la membrana externa. Por lo tanto, el tamaño molecular del lipopolisacárido se puede ver mediante SDS-PAGE, que es causado por la diferencia en el sistema de biosíntesis en lugar del factor del sistema de salida.

La distribución de la cadena lateral del antígeno O en diferentes bacterias es diferente, algunas de las cuales contienen unas 20 unidades repetidas y otras pueden tener unas 100 unidades repetidas. En la electroforesis SDS-PAGE, se refleja la diferencia en la intensidad de tinción de plata de diferentes moléculas de diferentes especies de bacterias. La razón de la diferente distribución de la longitud de la cadena lateral del antígeno O en diferentes bacterias puede ser que existe un factor de selección de tamaño en el proceso de policondensación del antígeno O o reacción de conexión. Wzz (es decir, Rol o Cld) es una proteína importante que regula la distribución de la longitud de la cadena lateral en bacterias que sintetizan antígenos a través de la vía dependiente de Wzy, pero su mecanismo específico aún no está claro.